中国第16次南极考察执行"一船两站"运行方案，雪龙船于1999年11月1日从上海启航，按上海---中山---蓬塔---长城---中山路线行驶。2000年3月1日返航，4月5日抵达上海港。整个航次历时157天，航行27053海里，累计破冰51小时，破冰43海里，创造了雪龙船6下南极，离站时间最晚的记录；同时，也创造了我国南极考察以来航程最远，破冰距离最长，一个航次4过西风带的记录。
    参加中国第16次南极考察的队员和记者来自9个部、局和12个省市以及美国，共137人。其中船员40人，随船大洋队、气象保障、队领导等19人，中山站54人，长城站21人，外籍3人。考察队中党员42人，占总人数30.6%；大专以上文化程度52人，占总人数48.6%。长城站考察队员和部分记者乘飞机前往，中山站队员搭乘雪龙船赴站。
    中国第16次南极考察，圆满完成了格罗夫山考察、大洋考察、收放沉积物捕集器以及站区度夏考察任务，获得了丰富的样品资料，为全面完成"九五"国家重点攻关项目奠定了基础。